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CRISPR und Cas12a(ursprünglicher Name)Cpf1(gehörtKlasse 2 Typ V CRISPR-SystemEs handelt sich um einen adaptiven Immunmechanismus von Bakterien und Antiquitäten, der dazu dient, invasive Viren oder Plasmoden-DNA zu erkennen und zu schneiden. Im Vergleich zu Cas9 bietet sein DUT-Arbeitsmodell erhebliche Vorteile bei der Genbearbeitung, molekularen Tests und der Multigen-Regulierung.

| Parameter | CRISPR und Cas12a | CRISPR und Cas9 |
|---|---|---|
| Protein Größe | 1.200-1.300 Aminosäuren (kleiner) | 1.000-1.600 Aminosäuren |
| RNA Abhängigkeit | Nur notwendigcrRNA(ohne TracRNA) | BedarfcrRNA + tracrRNAoder Chimerierung von sgRNA |
| crRNA Bearbeitung | Autonome RNase-Aktivität (eingebaute Verarbeitungsfähigkeit) | Abhängige Host RNase III und tracrRNA |
| Schnittende Typ | 黏性末端(5' 突出) | Flaches Ende |
| PAM-Erkennungssequenz | 5'-TTTN/TTTV-3'(reich an T) | 5'-NGG-3'(reich an G) |
| Nukleatase-Domäne | EinzelStrukturbereich RuvC | HNH + RuvC Doppelstrukturdomäne |
| Transschneideaktivität | Ja (kann ssDNA nicht spezifisch schneiden) | Nichts |
Anmerkung:
VZeigt A/C/G (nicht T) an, wie z.B. 5'-TTTA/TTTC/TTTG-3'.
黏性末端Einfachere Auslösung von homogenen Restrukturierungsreparaturen (HDR), um die Effizienz der präzisen Bearbeitung zu verbessern.
Multigen-Editing-Effizienz:
Ein einziges crRNA-Array kann auf mehrere Gene gleichzeitig ausgerichtet werden, ohne dass tracrRNA wiederholt konstruiert werden muss, und eignet sich für die Regulierung komplexer Wege.
AT-Anreicherung des Genoms:
Die Bearbeitung von AT-reichen Genomen (z. B. Pflanzen, Parasiten) ist deutlich effizienter als Cas9.
Niedriges Off-Target-Risiko:
Streng abhängig von PAM-Aktivierung, und die Trans-Cutting-Aktivität kann deaktiviert werden, mit einer genomweiten Offtarget-Rate niedriger als Cas9.
Einfache Lieferung:
Das Protein ist kleiner und kann leichter in Viren wie AAV verpackt werden und eignet sich für die Gentherapie im Körper.
| Anwendungsrichtung | Fälle | Vorteile zeigen |
|---|---|---|
| Multigen-Knock | Synchronisierte Bearbeitung von 3 Trockenbeständigkeitsgenen in Mais mit einer Bearbeitungseffizienz von >60% | Vereinfachte Konstruktion von crRNA-Arrays |
| Gengenaue Insertion | HDR-Verbesserung mit klebrigen Enden für menschliche FIX-Gen-Fixing-Reparatur | Hochtreue Reparatur |
| Molekuläre Diagnose | Nukleinsäureendetektion in Kombination mit Transschneideaktivität (CRISPR-DETECT) | Hohe Empfindlichkeit ohne PCR-Amplifikation |
| Antivirusforschung | BmNPV-Virus-Rezeptorgen in Seiden bearbeitet, 40% höhere Antiviralwirksamkeit als Cas9 | Effizientes Schneiden von AT-Bereicherungszonen |
| Gentherapie-Trägeroptimierung | 50 % geringere Offtarget-Rate von Cas12b (kleinere Variante) als von Cas9, klinisch geeignet | Hochsichere Lieferung |